HPC per la Bioinformatica

L'HPC al servizio della ricerca


U na soluzione chiavi in mano per laboratori di ricerca, industrie farmaceutiche, aziende biotech che si occupano di:

  • Drug Discovery
  • Next Generation Sequencing
  • analisi del genoma, proteoma, trascrittoma
  • System Biology
  • modellazione molecolare e determinazione della struttura delle proteine

A chi è rivolta

Le misure sperimentali condotte con varie tecniche di analisi producono un'enorme mole di informazioni di tipo “omics" (genomiche, proteomiche, metabolomiche). I progressi in campo biochimico hanno dato un impulso decisivo al sequenziamento del genoma di vari organismi, fra cui l'uomo, e sono disponibili oggi sequenziatori con elevatissimi throughput di dati in uscita.
Per poter gestire ed elaborare efficacemente questa gran mole di dati, le tecnologie del calcolo ad elevate prestazioni hanno assunto un'importanza fondamentale, e la disponibilità di sistemi HPC è oggi un fattore competitivo per la ricerca e lo sviluppo di nuovi farmaci e per ridurre i tempi di immissione sul mercato.
Realizzare un sistema HPC efficiente richiede esperienza a una conoscenza approfondita delle risorse hardware e software utilizzate. La nostra esperienza specifica in campo biotech e biomedicale nasce da più di 18 anni di realizzazioni per svariate aziende e istituti di ricerca accademici e privati.


Che cosa comprende

Il middleware

Il software

  • Installazione dei codici di calcolo
  • (es. AMBER, AutoDock, BLAST, Bioconductor, BowTie, EMBOSS, HMMER, MOE, SOAP...)

Il supporto


Punti di forza

  • Nasce dall'esperienza ventennale nella fornitura di sistemi HPC per applicazioni biotech/biomedicali
  • E' una soluzione progettata, costruita e ottimizzata per gestire grandi quantità di dati, elevanti throughput e per sfruttare al meglio gli applicativi di calcolo più utilizzati in questo ambito
  • La sezione storage può arrivare sino a 57 petabyte di capacità di memorizzazione e 360 GB/s di throughput
  • L'utente può dedicarsi interamente al proprio lavoro, a tutto il resto abbiamo già pensato noi
  • Offre massime prestazioni nell'esecuzione delle applicazioni, tramite un'attenta scelta dei componenti hardware in funzione delle esigenze degli applicativi software specifici
  • Consente scalabilità e flessibilità per poter espandere facilmente la capacità di calcolo nel tempo
  • I costi di acquisto e di esercizio sono contenuti in rapporto alla prestazioni di calcolo effettive

Ti serve di più?

Affidati ai nostri esperti HPC per personalizzare la soluzione in base alle necessità della tua organizzazione. I nostri servizi consulenziali comprendono l'analisi dei dati, la progettazione, l'implementazione, l'integrazione e ottimizzazione di algoritmi di calcolo paralleli e non, lo sviluppo di applicativi e ambienti software ad hoc.